J'ai été confronté à un problème particulier avec mon contrôleur de domaine. Depuis la migration en Samba 3.5.4 les machines ne faisant pas partie du domaine mais dont les utilisateurs possèdent un compte domaine n'étaient plus reconnu automatiquement.
Dans le fenêtre de demande du nom d'utilisateur / mot de passe il fallait ajouter MonDomain\nom d'utilisateur. Pas très pratique surtout pour certaines applications ou il est difficile de mettre en place une gestion de connexion.
Après pas mal de recherche j'ai découvert que c'est un comportement qui a changé depuis Samba 3.4 avec l'option
map untrusted to domain = no
Si vous la passez à yes vous retrouver le comportement d'avant. Plus d'informations : http://www.samba.org/samba/docs/man/manpages-3/smb.conf.5.html#MAPUNTRUSTEDTODOMAIN